После покупки Eidos компанией Square Enix, рано или позно должны были последовать некоторые изменения и сейчас можно увидеть, что в действиетльности принес первый этап изменений новым владельцам. В настоящее время Eidos работает как независимая студия. Это означает, что компания полностью находится в собственности Square Enix и является ее филиалом.
Фил Роджерс (Phil Rogers) как и прежде будет занимать должность президента студии и подчиняться непосредственно Йоичи Вада (Yoichi Wada). Square Enix кажется осталась очень довольной после приобретения студии Eidos, но предоставляя ей независимость она делает это так, чтобы Eidos и дальше была в состоянии создавать популярные во всем мире игровые продукты и укрепить свою позицию среди конкурентов.
Руководство Eidos будет представлено в прежнем ставе. Также стало известно, что группа Eidos Montreal работает над возрождением игр Deus Ex 3 и Thief, но появятся ли новые серии "возрожденных игр" до сих пор никто точно не знает. Также не было никаких заявлений относительно разработки и выхода продолжений для таких игр как Tomb Raider и Hitman, которые пользуются большой популярностью у пользователей и продолжение которых так с нетерпением ждут многие геймеры.
По сообщениям некоторых источников о своих будущих проектах, Eidos объявит только на E3 2009.